Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms