Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf1P09925 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Surf1P09925 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Surf1P09925 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Surf1P09925 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf1P09925 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Surf1P09925 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf1P09925 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Surf1P09925 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms