Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc8P09025 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms