Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefmP08553 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefmP08553 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefmP08553 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefmP08553 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NefmP08553 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefmP08553 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefmP08553 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefmP08553 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefmP08553 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NefmP08553 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefmP08553 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefmP08553 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefmP08553 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefmP08553 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms