Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa4P06728 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms