Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06323 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06323 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06323 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06323 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06323 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06323 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms