Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3dP04235 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3dP04235 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms