Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms