Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04219 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04219 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04219 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P04219 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04219 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04219 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms