Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04212 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P04212 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P04212 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P04212 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P04212 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms