Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hoxa7P02830 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa7P02830 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms