Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms