Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-AaP01910 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms