Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01797 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01797 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01797 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01797 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01797 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01797 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms