Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01643 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01643 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01643 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01643 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01643 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01643 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01643 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01643 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01643 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01643 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01643 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01643 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01643 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01643 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01643 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01643 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01643 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01643 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01643 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01643 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms