Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01641 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01641 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01641 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01641 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01641 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01641 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01641 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01641 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01641 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01641 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms