Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igk-V19-17P01633 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms