Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifnb1P01575 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifnb1P01575 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifnb1P01575 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms