Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ccl20O89093 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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