Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo1O89026 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo1O89026 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo1O89026 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms