Protein–RNA interactions for Protein: O89010

Magea6, MCG114343, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea6O89010 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Magea6O89010 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Magea6O89010 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Magea6O89010 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms