Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcn2O88968 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms