Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcnkO88874 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms