Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb2O88838 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms