Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms