Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BlmO88700 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BlmO88700 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BlmO88700 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BlmO88700 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BlmO88700 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BlmO88700 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BlmO88700 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BlmO88700 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BlmO88700 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BlmO88700 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BlmO88700 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BlmO88700 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BlmO88700 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BlmO88700 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BlmO88700 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BlmO88700 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BlmO88700 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BlmO88700 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BlmO88700 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BlmO88700 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BlmO88700 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BlmO88700 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms