Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a3O88561 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a3O88561 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms