Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops6O88545 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms