Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Dync1i1O88485 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dync1i1O88485 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms