Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfdp1O88271 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms