Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr1O70481 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubr1O70481 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubr1O70481 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms