Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad51dO55230 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad51dO55230 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms