Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChkbO55229 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChkbO55229 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms