Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms