Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms