Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg2O55111 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg2O55111 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms