Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms