Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl13O55038 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl13O55038 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms