Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copb2O55029 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms