Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CrxO54751 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CrxO54751 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CrxO54751 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CrxO54751 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CrxO54751 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CrxO54751 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CrxO54751 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CrxO54751 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CrxO54751 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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