Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NudcO35685 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NudcO35685 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NudcO35685 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NudcO35685 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NudcO35685 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NudcO35685 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NudcO35685 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NudcO35685 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NudcO35685 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms