Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1aO35526 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1aO35526 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1aO35526 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1aO35526 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1aO35526 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms