Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NmiO35309 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NmiO35309 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmiO35309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmiO35309 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmiO35309 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmiO35309 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmiO35309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmiO35309 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmiO35309 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmiO35309 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmiO35309 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmiO35309 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NmiO35309 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmiO35309 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmiO35309 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmiO35309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmiO35309 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmiO35309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmiO35309 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NmiO35309 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms