Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc18a3O35304 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc18a3O35304 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc18a3O35304 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc18a3O35304 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc18a3O35304 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms