Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc23O35125 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms