Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Scarb2O35114 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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