Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casq1O09165 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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