Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms