Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CckarO08786 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CckarO08786 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CckarO08786 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CckarO08786 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms