Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20939L7N243 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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